Hoạt động sản xuất tôm giống trên địa bàn tỉnh từ đầu năm đến nay tương đối sôi động, đối tượng sản xuất, bao gồm tôm sú và tôm thẻ chân trắng, trong đó tôm sú vẫn được xác định là đối tượng chủ lực. Hiện nay toàn tỉnh có khoảng 296 cơ sở hoạt động sản xuất tôm giống, trong đó 210 cơ sở sản xuất tôm sú với tổng thể tích hồ ương 42.000 m3 và 86 cơ sở sản xuất tôm thẻ chân trắng với tổng thể tích hồ ương 33.000 m3.

Từ đầu năm đến nay, tổng sản lượng tôm giống sản xuất được 5 tỷ con đạt 37 % kế hoạch và đạt 100 % so với cùng kỳ năm 2011, trong đó sản lượng tôm sú giống 2 tỷ con và 3 tỷ tôm thẻ chân trắng. Giá tôm sú dao động ở mức cao, từ 45-75 đ/con và giá tôm thẻ chân trắng dao động 20-82 đ/con.

Tuy nhiên, sản xuất giống vẫn còn gặp một số khó khăn như:

- Nguồn giống tôm sú bố mẹ khan hiếm và chất lượng ngày càng giảm; nguồn giống tôm thẻ chân trắng bố mẹ nhập từ nhiều nguồn khác nhau và chất lượng không ổn định gây khó khăn cho sản xuất.

- Thời tiết khí hậu thay đổi đột ngột, môi trường nước không ổn định, tỷ lệ nhiễm bệnh tương đối cao. Từ đầu năm đến nay tỷ lệ nhiễm MBV tương đối cao, dao động 25-30 % tổng số mẫu kiểm tra, ngoài ra phát hiện 2 mẫu nhiễm WSSV (đạt 0,6 % mẫu kiểm tra) và 4 mẫu nhiễm IHHNV (đạt 6 % mẫu kiểm tra).

- Giá nguyên liệu đầu vào tăng mạnh, đặc biệt nguồn Artemia không ổn định, khan hiếm và giá cao.

- Hoạt động sang nhượng trại và chuyển đổi đối tượng sản xuất giữa tôm sú, tôm thẻ chân trắng, ốc hương diễn ra phức tạp gây khó khăn cho công tác quản lý.

- Một số công ty gia hóa tôm bố mẹ đưa vào sản xuất trong khi chưa có quy định quản lý về việc gia hóa tôm bố mẹ từ khâu đăng ký hoạt động sản xuất đến giám sát, thử nghiệm chất lượng con giống từ nguồn tôm bố mẹ này gây hoang mang cho bà con nuôi tôm.